AMYTS, ante los resultados de la oposición de Aparato Digestivo del año 2015, denunció ante la Justicia la sospecha de irregularidades en el desarrollo de la OPE de dicha especialidad ese mismo año. La denuncia motivó un informe estadístico de validación de resultados elaborado por la propia autoridad."Ante la inacción de la Administración y dado que los resultados de la fase de oposición están significativamente fuera de lo normal", el Comité Ejecutivo de la Asociación decidió poner en conocimiento de la Fiscalía y, posteriormente, elevar denuncia al juzgado de lo penal.
Así, el juzgado de instrucción nº 12, en un auto de fecha 6 de julio de 2018, declara que "las anteriores actuaciones presentan características que hacen presumir la posible existencia de una infracción penal", por lo que "es procedente acordar la incoación de diligencias previas y practicar aquellas esenciales encaminadas a determinar la naturaleza y circunstancias del hecho".